La Asociación de Madres y Padres del Alumnado (AMPA) del IES San José es la entidad que facilita la participación de las familias en la vida del centro. Su objetivo principal es actuar como un canal de colaboración entre las familias y el instituto, sirviendo de cauce para la representación de padres, madres y tutores en la gestión y el Consejo Escolar.